功能食品学科于2012年获得硕士学位授予权，是我校在一级学科“食品科学与工程（代码0832）”下自主设置的目录外二级学科，现设有“食品功能成分及功效研究”和“功能食品的开发及质量控制”两个研究方向，毕业后授予工学硕士学位。本学科现拥有“普洱茶学教育部重点实验室”、“云南省茶深加工工程技术研究中心”和“农业部云南茶树及茶叶加工科学观测实验站”各1个，在云南特色食品（如普洱茶、咖啡等）功能因子功效机理与产业开发研究等方面具有较强的实力和优势。近年来承担省、部级以上科研项目14项，在研经费1800余万元；主编或副主编教材、专著10余部、发表科研论文40余篇(SCI收录8篇)；获得国家发明专利授权6项；获省政府科技进步一等奖1项、二等奖1项、三等奖2项。