为了适应云南茶产业的发展，做大、做强、做优普洱茶，经有关部门批准，云南普洱茶研究院于2005年11月19日在云南农业大学正式成立，成为云南高校中唯一的茶叶研究机构。

云南普洱茶研究院现有研究人员20余人, 其中教授、研究员8人，副教授10人，博士5人，科研方面先后承担了省科技厅、省政府、省农业农村厅、省教育厅等20多项科研项目。在云南茶树种质资源、普洱茶加工工艺与品质的关系、普洱茶内含功能性成分研究、云南大叶种优质茶叶加工、茶叶综合利用等方面取得丰硕的成果。

云南普洱茶研究院的建立，将利用高校人才、科研、教育资源优势，构建专业普洱茶研究平台及研发人才团队，完善普洱茶产业研究体系，开展以普洱茶为核心的特色项目研究，其中包括普洱茶种质资源遗传多样性研究；生态普洱茶园管理关键技术研究；普洱茶后发酵关键技术研究；普洱茶深加工产品研发及综合利用研究；利用有益微生物提高普洱茶品质的研究；普洱茶产品品质鉴评研究；普洱茶品质安全性评价研究；普洱茶文化产业可持续发展研究等，这对云南茶产业的跨越式的发展将产生重要作用。